El Aula de la Naturaleza de Máguez está situada en el norte de Lanzarote, en la localidad de Máguez, en el valle agrícola y ganadero del mismo nombre, del término municipal de Haría, reuniendo en sus proximidades importantes valores geológicos, biológicos y paisajísticos. No en vano se encuentra entre dos de los principales espacios protegidos de la isla, El Monumento Natural de la Corona y el Parque Natural del Archipiélago Chinijo.
La Zona es un fértil valle agrícola y ganadero de clima suave, situado a unos 300 metros de altitud. El valle de Máguez está cerrado al Norte por una alineación de volcanes recientes, al Oeste por el acantilado de Famara y al Sur por una crestería que lo separa del vecino valle de Haría. Al Este, el valle se abre en amplios llanos que contactan con el Malpaís de la Corona, originado por la erupción del cercano volcán de Monte Corona.